针对高等教育管理，其发展历史更短，还处于起步阶段。尽管大学的发展有800多年的历史，但系统的研究大学管理、研究高等教育管理的历史并不长，只有几十年的历史，在我国时间则更短，是20世纪80年代从国外引进的，只有短短的二十多年的历史。因此，很多理论问题还没有研究清楚，很多现实问题还不能解释，很多基础问题还在研究探索之中，没有统一的答案。总之，学科还很年轻，存在的问题还很多，概括而言：
第一，从概念上看，其他学科概念多，本学科的概念少，如果抽取其他学科的概念，学科框架就会倒塌。如同陈桂生先生形容教育学一样：“教育学成为别的学科领地”。
第二，从内容看，规定的内容多，解释的内容少。
第三，从研究方法看，演绎的内容多，实证的内容少。
第四，从研究规范看，议论的内容多，研究的内容少。